MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 31587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_012811	CCG	2	6	1238682	1238687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142910
31002	NC_012811	CGC	2	6	1238767	1238772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142910
31003	NC_012811	GCC	2	6	1238792	1238797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142910
31004	NC_012811	CTGC	2	8	1238812	1238819	0 %	25 %	25 %	50 %	240142910
31005	NC_012811	CTC	2	6	1238879	1238884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142910
31006	NC_012811	CGG	2	6	1238955	1238960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142910
31007	NC_012811	GCC	2	6	1238963	1238968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142910
31008	NC_012811	CGC	3	9	1238994	1239002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142911
31009	NC_012811	CCT	2	6	1239190	1239195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142911
31010	NC_012811	CG	3	6	1239246	1239251	0 %	0 %	50 %	50 %	240142911
31011	NC_012811	GGCC	2	8	1239296	1239303	0 %	0 %	50 %	50 %	240142911
31012	NC_012811	TCG	3	9	1239338	1239346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142911
31013	NC_012811	CGGA	2	8	1239396	1239403	25 %	0 %	50 %	25 %	240142911
31014	NC_012811	TCG	2	6	1239404	1239409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142911
31015	NC_012811	GCG	2	6	1239421	1239426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142911
31016	NC_012811	GAA	2	6	1239432	1239437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240142911
31017	NC_012811	CTG	2	6	1239439	1239444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142911
31018	NC_012811	CCG	2	6	1239449	1239454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142911
31019	NC_012811	GGCT	2	8	1239460	1239467	0 %	25 %	50 %	25 %	240142911
31020	NC_012811	TCC	2	6	1239494	1239499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142911
31021	NC_012811	TCGCTC	2	12	1239526	1239537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240142911
31022	NC_012811	GGAG	2	8	1239540	1239547	25 %	0 %	75 %	0 %	240142911
31023	NC_012811	CGAC	2	8	1239548	1239555	25 %	0 %	25 %	50 %	240142911
31024	NC_012811	CGA	2	6	1239579	1239584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142911
31025	NC_012811	CGG	2	6	1239671	1239676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142911
31026	NC_012811	CGG	2	6	1239755	1239760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142911
31027	NC_012811	GGA	2	6	1239807	1239812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142911
31028	NC_012811	CTGCC	2	10	1239997	1240006	0 %	20 %	20 %	60 %	240142912
31029	NC_012811	CG	3	6	1240030	1240035	0 %	0 %	50 %	50 %	240142912
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31033	NC_012811	CTGG	2	8	1240204	1240211	0 %	25 %	50 %	25 %	240142913
31034	NC_012811	TCG	3	9	1240254	1240262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142913
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31036	NC_012811	TCCT	2	8	1240352	1240359	0 %	50 %	0 %	50 %	240142913
31037	NC_012811	GCG	2	6	1240416	1240421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142913
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31042	NC_012811	CGC	2	6	1240684	1240689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142913
31043	NC_012811	TCG	2	6	1240770	1240775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142913
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31047	NC_012811	CGA	2	6	1240930	1240935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142913
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31049	NC_012811	GCCGGC	2	12	1241005	1241016	0 %	0 %	50 %	50 %	240142913
31050	NC_012811	TCT	2	6	1241035	1241040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142913
31051	NC_012811	TCG	2	6	1241103	1241108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142913
31052	NC_012811	TCG	2	6	1241127	1241132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142913
31053	NC_012811	CGG	2	6	1241229	1241234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142913
31054	NC_012811	GGTCGA	2	12	1241361	1241372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240142914
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31057	NC_012811	CGC	2	6	1241483	1241488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142914
31058	NC_012811	GGA	2	6	1241529	1241534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142914
31059	NC_012811	GCCGC	2	10	1241589	1241598	0 %	0 %	40 %	60 %	240142914
31060	NC_012811	CGA	2	6	1241601	1241606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142914
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31065	NC_012811	GAG	2	6	1241728	1241733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142914
31066	NC_012811	GCC	2	6	1241755	1241760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142914
31067	NC_012811	GC	3	6	1241761	1241766	0 %	0 %	50 %	50 %	240142914
31068	NC_012811	CGG	2	6	1241779	1241784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142914
31069	NC_012811	GGC	2	6	1241802	1241807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142914
31070	NC_012811	GCGGG	2	10	1241835	1241844	0 %	0 %	80 %	20 %	240142914
31071	NC_012811	GCC	2	6	1241879	1241884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142914
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31075	NC_012811	CGAG	2	8	1241990	1241997	25 %	0 %	50 %	25 %	240142914
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31077	NC_012811	GC	3	6	1242116	1242121	0 %	0 %	50 %	50 %	240142914
31078	NC_012811	TGC	2	6	1242164	1242169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142914
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31085	NC_012811	GCCCAT	2	12	1242282	1242293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240142914
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31088	NC_012811	GTC	2	6	1242366	1242371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31089	NC_012811	GGAC	2	8	1242395	1242402	25 %	0 %	50 %	25 %	240142915
31090	NC_012811	CGT	2	6	1242467	1242472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142915
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31096	NC_012811	GC	3	6	1242794	1242799	0 %	0 %	50 %	50 %	240142915
31097	NC_012811	GCC	2	6	1242801	1242806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142915
31098	NC_012811	CAGG	2	8	1242821	1242828	25 %	0 %	50 %	25 %	240142915
31099	NC_012811	CG	3	6	1242858	1242863	0 %	0 %	50 %	50 %	240142915
31100	NC_012811	ACG	2	6	1242892	1242897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31101	NC_012811	GCCG	2	8	1242904	1242911	0 %	0 %	50 %	50 %	240142915
31102	NC_012811	CGA	2	6	1242932	1242937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31103	NC_012811	GCGG	2	8	1243015	1243022	0 %	0 %	75 %	25 %	240142915
31104	NC_012811	GCTC	2	8	1243028	1243035	0 %	25 %	25 %	50 %	240142915
31105	NC_012811	GAC	3	9	1243077	1243085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31106	NC_012811	TCG	2	6	1243105	1243110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31107	NC_012811	GGC	2	6	1243111	1243116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142915
31108	NC_012811	CGT	2	6	1243139	1243144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31109	NC_012811	GCA	2	6	1243170	1243175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31110	NC_012811	GCC	2	6	1243200	1243205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142915
31111	NC_012811	CTG	4	12	1243251	1243262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142915
31112	NC_012811	TTC	2	6	1243305	1243310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142915
31113	NC_012811	CAA	2	6	1243313	1243318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240142915
31114	NC_012811	GAAT	2	8	1243357	1243364	50 %	25 %	25 %	0 %	240142915
31115	NC_012811	TCG	2	6	1243418	1243423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31116	NC_012811	CCG	2	6	1243473	1243478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31117	NC_012811	CGT	2	6	1243501	1243506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31118	NC_012811	GCCG	2	8	1243525	1243532	0 %	0 %	50 %	50 %	240142916
31119	NC_012811	TCA	2	6	1243533	1243538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142916
31120	NC_012811	GAT	2	6	1243592	1243597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142916
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31123	NC_012811	CAT	2	6	1243829	1243834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142916
31124	NC_012811	CGT	2	6	1243888	1243893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142916
31125	NC_012811	GC	3	6	1243927	1243932	0 %	0 %	50 %	50 %	240142916
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31232	NC_012811	CT	3	6	1247874	1247879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31233	NC_012811	AGGG	2	8	1247887	1247894	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31234	NC_012811	CGACCG	2	12	1247951	1247962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31235	NC_012811	TCC	2	6	1247975	1247980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31236	NC_012811	GGA	2	6	1248057	1248062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142922
31237	NC_012811	CGT	2	6	1248063	1248068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142922
31238	NC_012811	CAT	2	6	1248072	1248077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142922
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31241	NC_012811	CGA	2	6	1248137	1248142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142922
31242	NC_012811	TG	3	6	1248160	1248165	0 %	50 %	50 %	0 %	240142922
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31246	NC_012811	CGT	2	6	1248303	1248308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142922
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31256	NC_012811	TTCC	2	8	1248691	1248698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31257	NC_012811	CTC	2	6	1248751	1248756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142923
31258	NC_012811	CCTCG	2	10	1248783	1248792	0 %	20 %	20 %	60 %	240142923
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31262	NC_012811	CCCG	2	8	1248970	1248977	0 %	0 %	25 %	75 %	240142923
31263	NC_012811	GC	3	6	1248982	1248987	0 %	0 %	50 %	50 %	240142923
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31276	NC_012811	ATC	2	6	1249378	1249383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142924
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31304	NC_012811	CG	3	6	1250465	1250470	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
31305	NC_012811	ACT	2	6	1250484	1250489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142925
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31321	NC_012811	GTCC	2	8	1251210	1251217	0 %	25 %	25 %	50 %	240142925
31322	NC_012811	GCG	2	6	1251278	1251283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31323	NC_012811	CCG	2	6	1251324	1251329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142926
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31326	NC_012811	CG	3	6	1251514	1251519	0 %	0 %	50 %	50 %	240142926
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31330	NC_012811	CAGC	2	8	1251657	1251664	25 %	0 %	25 %	50 %	240142926
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31332	NC_012811	CTG	2	6	1251829	1251834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142926
31333	NC_012811	GCA	2	6	1251889	1251894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142926
31334	NC_012811	CGC	3	9	1251898	1251906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142926
31335	NC_012811	GAT	2	6	1251930	1251935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142926
31336	NC_012811	GC	3	6	1252044	1252049	0 %	0 %	50 %	50 %	240142927
31337	NC_012811	CGA	2	6	1252071	1252076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142927
31338	NC_012811	CGACGC	2	12	1252080	1252091	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	240142927
31339	NC_012811	TCG	3	9	1252129	1252137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142927
31340	NC_012811	CG	3	6	1252174	1252179	0 %	0 %	50 %	50 %	240142927
31341	NC_012811	GCG	2	6	1252218	1252223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142927
31342	NC_012811	CGG	2	6	1252277	1252282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142928
31343	NC_012811	GAC	2	6	1252305	1252310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142928
31344	NC_012811	CG	3	6	1252311	1252316	0 %	0 %	50 %	50 %	240142928
31345	NC_012811	CGT	2	6	1252322	1252327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142928
31346	NC_012811	ACGCT	2	10	1252379	1252388	20 %	20 %	20 %	40 %	240142928
31347	NC_012811	CGG	3	9	1252397	1252405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142928
31348	NC_012811	GGA	2	6	1252409	1252414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142928
31349	NC_012811	CTT	2	6	1252424	1252429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142928
31350	NC_012811	TGG	2	6	1252515	1252520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142928
31351	NC_012811	CCG	2	6	1252570	1252575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142928
31352	NC_012811	TCA	2	6	1252577	1252582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142928
31353	NC_012811	GGC	2	6	1252583	1252588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142928
31354	NC_012811	ATC	2	6	1252652	1252657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31355	NC_012811	AAC	2	6	1252694	1252699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31356	NC_012811	AAG	2	6	1252750	1252755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31357	NC_012811	CAT	2	6	1252768	1252773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31372	NC_012811	TCCT	2	8	1253388	1253395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31373	NC_012811	CG	3	6	1253415	1253420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31374	NC_012811	CGA	2	6	1253432	1253437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142930
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31385	NC_012811	TGGG	2	8	1253771	1253778	0 %	25 %	75 %	0 %	240142930
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31412	NC_012811	TCG	2	6	1254583	1254588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142930
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31423	NC_012811	GGCC	2	8	1254929	1254936	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
31424	NC_012811	TGC	2	6	1254973	1254978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142930
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31427	NC_012811	CTG	2	6	1255092	1255097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142931
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31450	NC_012811	CGG	2	6	1256311	1256316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142932
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31463	NC_012811	GCCGAC	2	12	1256877	1256888	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	240142933
31464	NC_012811	TGC	2	6	1256918	1256923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142933
31465	NC_012811	GCG	2	6	1256924	1256929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142933
31466	NC_012811	CGG	2	6	1256934	1256939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142933
31467	NC_012811	GA	3	6	1257008	1257013	50 %	0 %	50 %	0 %	240142933
31468	NC_012811	AGCG	2	8	1257048	1257055	25 %	0 %	50 %	25 %	240142934
31469	NC_012811	GAG	2	6	1257060	1257065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142934
31470	NC_012811	GCC	2	6	1257130	1257135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142934
31471	NC_012811	GCG	2	6	1257136	1257141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142934
31472	NC_012811	CGT	2	6	1257230	1257235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142934
31473	NC_012811	CGCC	2	8	1257247	1257254	0 %	0 %	25 %	75 %	240142934
31474	NC_012811	TCG	2	6	1257277	1257282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142934
31475	NC_012811	GAG	2	6	1257314	1257319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142934
31476	NC_012811	GGC	3	9	1257491	1257499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142934
31477	NC_012811	CTGGG	2	10	1257534	1257543	0 %	20 %	60 %	20 %	240142934
31478	NC_012811	GGA	2	6	1257551	1257556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142934
31479	NC_012811	GC	3	6	1257563	1257568	0 %	0 %	50 %	50 %	240142934
31480	NC_012811	CG	3	6	1257592	1257597	0 %	0 %	50 %	50 %	240142934
31481	NC_012811	GCG	2	6	1257643	1257648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31482	NC_012811	CGT	2	6	1257669	1257674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31483	NC_012811	CGA	2	6	1257716	1257721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31484	NC_012811	TGC	2	6	1257736	1257741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31485	NC_012811	CCG	2	6	1257742	1257747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31486	NC_012811	CTG	2	6	1257780	1257785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31487	NC_012811	GCG	2	6	1257789	1257794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142935
31488	NC_012811	CGA	2	6	1257809	1257814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31489	NC_012811	ACC	2	6	1257826	1257831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142935
31490	NC_012811	CCG	2	6	1257833	1257838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31491	NC_012811	GCG	2	6	1257854	1257859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142935
31492	NC_012811	GCC	2	6	1257930	1257935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31493	NC_012811	GCCGG	2	10	1257939	1257948	0 %	0 %	60 %	40 %	240142935
31494	NC_012811	CGT	2	6	1257971	1257976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31495	NC_012811	CGG	2	6	1257980	1257985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142935
31496	NC_012811	GCC	2	6	1258028	1258033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31497	NC_012811	CG	3	6	1258051	1258056	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
31498	NC_012811	AAC	2	6	1258083	1258088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240142935
31499	NC_012811	GCA	2	6	1258115	1258120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31500	NC_012811	CG	3	6	1258139	1258144	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935

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